Boekhouder.nl
Webshop Boekhouding 2026

Laatste update: juli 2026 • Onafhankelijk getest

Beste boekhoudprogramma voor je webshop: koppel je verkopen en btw automatisch

Als webshophouder wil je bezig zijn met verkoop, niet met het handmatig overtikken van orders en betalingen. Door je webshop (zoals Shopify of WooCommerce) direct te koppelen aan een boekhoudprogramma, worden bestellingen automatisch verwerkt [01, 02]. Dit bespaart tijd en voorkomt fouten bij het matchen van betalingen via Payment Service Providers (PSP's) zoals Mollie [04].

Daarnaast gelden er strenge regels voor e-commerce. Verkoop je over de grens in de EU en ga je over de drempel van € 10.000 heen? Dan moet je buitenlandse btw berekenen en dit via de One Stop Shop (OSS) aangeven [08, 14]. Ook moet je administratie van deze EU-transacties wettelijk 10 jaar bewaard blijven [13, 29]. Zorg dus voor software die dit automatisch voor je splitst en exporteert bij een eventuele opzegging [45, 46, 47].

Of je nu een startende webshop hebt met weinig orders of een omnichannel winkel met fysieke voorraad; de juiste software helpt je om de administratie zelf te regelen of soepel over te dragen aan je boekhouder [01, 03]. Vergelijk de opties en kies het pakket dat past bij jouw verkoopvolume en platform.

SNEL ANTWOORD PER SITUATIEBekijk uitleg
Startende webshop met weinig orders (~300/maand) en klein budget
e-Boekhouden.nl, Moneybird, Jortt
Veel internationale EU-verkopen boven de € 10.000 drempel (OSS-regeling)
Moneybird, Exact Online
Webshop met fysieke winkel of eigen voorraadbeheer nodig
SnelStart, Exact Online
Veel transacties via Mollie die automatisch gekoppeld moeten worden
Exact Online, Jortt, Moneybird
Onafhankelijke vergelijking van webshop-koppelingen
Up-to-date met de nieuwste btw- en OSS-regels voor 2026
Getest op koppelingen met Shopify, WooCommerce en Mollie
Praktisch advies zonder ingewikkelde boekhoudtaal
Laatst gecontroleerd: 20 juli 2026
Prijzen en voorwaarden: maandelijks gecontroleerd
Beoordeeld door: Boekhouder.nl Research Team
Commerciële relaties: worden vermeld
Bekijk methodologie
Boekhouder.nl kan een vergoeding ontvangen wanneer je via een link een product kiest. Dit heeft geen invloed op onze beoordelingscriteria. Lees hoe wij vergelijken en geld verdienen
Expert take
BR

Boekhouder.nl Research Team

Redactie zakelijke software

Het beste pakket is het pakket dat past bij hoe jij werkt, niet het pakket met de laagste prijs.

Mijn advies: Kies op werkwijze — bonnetjes scannen versus zelf uren schrijven — en niet alleen op prijs. Controleer ook of de btw-aangifte native in het pakket zit of alleen via een koppeling loopt.

In het kort

Als e-commerce ondernemer moet je voldoen aan strenge regels, zoals de verplichte herroepingsknop vanaf juni 2026 [32] en de btw-OSS-regeling bij buitenlandse EU-omzet boven de €10.000 [08, 14]. Voor een eenvoudige start kun je zelf software gebruiken zoals e-Boekhouden.nl vanaf €9.95 per maand [01] of Moneybird voor €15 tot €42 per maand [01]. Grotere webshops met eigen voorraad kunnen beter kiezen voor Exact Online van €49 tot €99 per maand [01] of SnelStart voor €16 tot €22 per maand [01, 18]. Schakel bij twijfel een boekhouder in om te zorgen dat je administratie voldoet aan de wettelijke bewaartermijn van 10 jaar voor OSS-transacties [13, 29].

Bron: openbare tarieven, peildatum 20 juli 2026

Persona-kaarten voor e-commerce boekhoudsoftware (juli 2026)

Kies het profiel dat het beste bij jouw webshop past. Ontdek wat je zelf moet regelen, waar je op moet letten en welke software het beste aansluit bij jouw situatie.

Keuzehulp Boekhoudsoftware voor Webshops

Ontdek binnen twee minuten welke boekhoudsoftware het beste past bij uw webshop. Beantwoord vijf eenvoudige vragen en krijg direct onafhankelijk advies om uw administratie slim in te richten.

1. Wat is de situatie van uw webshop?
2. Hoeveel bestellingen verwerkt u ongeveer per maand?
3. Wie gaat er met de boekhoudsoftware werken?
4. Wat zijn uw belangrijkste prioriteiten? (Kies maximaal 3)
5. Welk webshop-platform gebruikt u?

Beantwoord minimaal vraag 1 t/m 3

Boekhoudpakketten vergeleken

Overzicht van de onderzochte boekhoudpakketten voor dit scenario.

Aanbevolen
E

e-Boekhouden.nl

Online boekhoudpakket

Bron: openbare tarieven
Laatst gecontroleerd: 20 juli 2026

Gratis mobiele app voor het scannen van bonnen, urenregistratie en het versturen van facturen.Automatische bankkoppelingen met ING, Rabobank en bunq zijn gratis; voor andere banken zoals Knab betaal je €0,99 per maand.Scan & Herken-tegoed is onbeperkt geldig en beschikbaar vanaf €0,09 per credit.Inclusief gratis urenregistratie en voorraadbeheer (als de facturatiemodule actief is).

Waarom aanbevolen: Startende ondernemers (tot 15 maanden na KVK-inschrijving) kunnen de software de eerste 15 maanden volledig gratis gebruiken [18]. Je kunt de btw-aangifte en ICP-aangifte met één klik direct elektronisch naar de Belastingdienst sturen zonder dat je extra inlogcodes nodig hebt [05, 28]. Er is gratis telefonische support op werkdagen van 09:00 tot 17:00, wat ideaal is als je snel antwoord wilt op vragen over de software [16]. Je zit niet vast aan een jaarcontract; alle pakketten zijn maandelijks opzegbaar [01, 15].

Minder geschikt als: Ondernemers met veel transacties; het ZZP-pakket van €9,95 per maand heeft een harde grens van 240 boekingen per jaar, waarna je automatisch overgaat naar een duurder pakket vanaf €14,50 per maand [01, 35]. Expatriates en anderstaligen, omdat de software en de klantenservice uitsluitend in het Nederlands beschikbaar zijn [19]. Ondernemers die een zeer moderne interface of slimme AI-automatisering voor bankafschriften zoeken; de vormgeving is vrij traditioneel [02, 05, 11].

Belangrijkste beperking: Als je je abonnement opzegt, wordt je account direct volledig gesloten zonder gratis leesmodus, waardoor je zelf vooraf handmatig al je gegevens en XML-Auditfiles moet exporteren om aan de wettelijke bewaarplicht te voldoen [15, 16, 32].

MAANDKOSTEN

Bekijk actuele voorwaarden

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Aanbevolen
EO

Exact Online

Online boekhoudpakket voor het mkb en accountants

Bron: openbare tarieven
Laatst gecontroleerd: 20 juli 2026

Automatisch afletteren van bankafschriften aan openstaande facturen.Directe btw- en ICP-aangifte via PKI-certificaten.Abonnementen hebben een opzegtermijn van één maand en opzeggen kan alleen direct binnen de softwareomgeving.

Waarom aanbevolen: Zeer krachtige en complete ERP- en boekhoudfuncties die geschikt zijn voor complexe bedrijfsprocessen [11, 12]. Gratis en naadloze samenwerking met je accountant, die via een eigen licentie kosteloos kan inloggen [01]. Handige mobiele app voor iOS en Android om onderweg bonnen te scannen en direct betalingen te doen [01, 15]. Directe btw-aangifte en opgaaf ICP indienen bij de Belastingdienst via een beveiligde koppeling [01, 08].

Minder geschikt als: Starters en zzp'ers, vanwege de hoge instapprijs vanaf €49/maand [01] en de krappe limiet van 25 verkoopfacturen in het Essentials-pakket [01, 18]. Ondernemers die een moderne en snelle interface zoeken; de desktopomgeving wordt vaak als traag en niet-intuïtief ervaren [09, 12]. Bedrijven die flexibel willen blijven, omdat overstappen naar een andere aanbieder erg lastig is door moeilijke data-export [19, 23].

Belangrijkste beperking: In de pakketten Essentials, Plus en Professional geldt een harde limiet van 10.000 boekingsregels per administratie per maand, waardoor je bij overschrijding verplicht moet upgraden naar het Premium-tarief vanaf €299/maand [01, 03, 09].

MAANDKOSTEN

Bekijk actuele voorwaarden

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Aanbevolen
J

Jortt

Online boekhoudpakket met sterke automatisering

Bron: openbare tarieven
Laatst gecontroleerd: 20 juli 2026

Gratis Starter-pakket (€0 per maand) beschikbaar voor beginnende ondernemers met een limiet van 10 uitgaande facturen per uur.Salarisadministratie optioneel toe te voegen voor €9,50 per loonstrook per actieve medewerker per maand (excl. btw).Automatische back-up van al je bonnen en facturen naar Dropbox om eenvoudig te voldoen aan de wettelijke bewaarplicht van 7 jaar.Ondersteuning voor Peppol-facturatie en snelle betalingen via iDeal, QR-codes en Wero.

Waarom aanbevolen: De slimme 'Boekhoudbot' automatiseert tot wel 96% van je banktransacties, waardoor je zelf nauwelijks nog handmatig hoeft te boeken [04, 07, 20]. Je btw-aangifte staat door de realtime bankkoppeling automatisch voor je klaar en stuur je met één klik rechtstreeks naar de Belastingdienst [05, 09]. Samenwerken met extra gebruikers is gratis binnen de limieten van je pakket, en vanaf het MKB-pakket van €24,95 per maand kun je onbeperkt bankrekeningen koppelen [01, 03, 05]. De software is speciaal ontworpen voor ondernemers zonder boekhoudkennis en gebruikt begrijpelijke taal in plaats van ingewikkeld financieel jargon [13].

Minder geschikt als: Ondernemers die intensief samenwerken met een traditionele accountant; Jortt weigert CSV- of Excel-exports van grootboekkaarten te leveren, wat voor frictie of extra kosten bij je adviseur kan zorgen [01, 02]. Bedrijven die onder meerdere handelsnamen factureren of directe API-koppelingen met grote e-commerceplatformen nodig hebben [02]. Ondernemingen die behoefte hebben aan voorraadbeheer of factureren in vreemde valuta, aangezien Jortt alleen euro's ondersteunt en geen voorraadmodule heeft [27].

Belangrijkste beperking: Bij het opzeggen of downgraden van je abonnement verlies je direct de toegang tot al je opgeslagen documenten en boekingshistorie, waardoor je genoodzaakt bent om zelf tijdig een volledige export te maken of te blijven betalen om aan de fiscale bewaarplicht te voldoen [02, 10, +2].

MAANDKOSTEN

Bekijk actuele voorwaarden

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

M

Moneybird

Online boekhoudsoftware

Bron: openbare tarieven
Laatst gecontroleerd: 20 juli 2026

Volledige ondersteuning voor de Kleineondernemersregeling (KOR) bij een jaaromzet tot € 20.000.Gratis toegang voor uw boekhouder of accountant via een speciale kantooromgeving.Ingebouwde urenregistratie die u eenvoudig exporteert naar PDF of Excel.Mogelijkheid om een RGS Brugstaat te exporteren, mits alle categorieën aan een RGS 3.5-code zijn gekoppeld.

Waarom aanbevolen: Zeer gebruiksvriendelijk platform waarmee u binnen 30 seconden een factuur maakt en automatische betalingsherinneringen instelt [03, 11]. Directe en foutloze btw- en ICP-aangifte naar de Belastingdienst, zonder dat u XML-bestanden handmatig hoeft te uploaden [03, 06, 07]. Slimme mobiele app met een snelle en nauwkeurige bonnenscanner die bonnen direct herkent en verwerkt [03].

Minder geschikt als: Groeiende bedrijven en bv-structuren die behoefte hebben aan traditionele grootboekrekeningen of consolidatie van meerdere administraties [04, 10]. Ondernemers die bij spoed direct telefonische ondersteuning willen; de klantenservice werkt alleen via e-mail en een AI-chatbot [01, 13, 14]. Gebruikers met een klein budget die wel een automatische bankkoppeling willen, aangezien deze functie ontbreekt in het goedkoopste Start-pakket [02].

Belangrijkste beperking: Moneybird dwingt u bij een hoger aantal banktransacties snel naar duurdere pakketten en mist geavanceerde functies zoals een traditioneel grootboekschema en multi-entity consolidatie voor grotere bedrijven [02, 04, 10].

MAANDKOSTEN

Bekijk actuele voorwaarden

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

S

SnelStart

Online boekhoudsoftware

Bron: openbare tarieven
Laatst gecontroleerd: 20 juli 2026

SnelStart Bankieren (via partner Adyen) biedt een zakelijke rekening met betaalpas voor €7,50 per maand, gratis vanaf het inKaart-pakket.Btw-aangifte indienen via een collectief PKI-certificaat, zodat je zelf geen eHerkenning hoeft aan te vragen.SnelStart Fiscaal (inbegrepen in het Accountant-pakket van €49,50 per maand) voor geïntegreerde IB- en VPB-aangiftes met directe VIA-import.

Waarom aanbevolen: Naadloze, realtime samenwerking met je accountant of boekhouder zonder handmatige exports, wat je tijd en accountantskosten bespaart [08, 15]. Snelle verwerking van bonnen en facturen via de goed beoordeelde mobiele app met automatische scan-en-herkenfunctie (OCR) [26, 28]. Automatische dagelijkse bankkoppelingen vanaf het inOrde-pakket (€9,50 per maand) [01, 13] of volledig geïntegreerd bankieren via SnelStart Bankieren [01, 45].

Minder geschikt als: Zelfstandige zzp'ers die zelf hun btw-aangifte willen regelen met het inStap-instappakket (€15,50 per maand), omdat deze functie pas vanaf het inKaart-pakket (€22,00 per maand) beschikbaar is [01, 03, 05]. Autobedrijven en handelaren in margegoederen, omdat SnelStart de individuele margeregeling niet ondersteunt en de eigen garagemodule is uitgefaseerd [18, 23]. Ondernemers die veel met data-analyses werken, aangezien de webversie (Polaris) geen directe Excel-exports van klantgegevens of transacties toestaat [19, 25, 50].

Belangrijkste beperking: De software is functioneel sterk verdeeld tussen de verouderde Windows-desktopversie (SnelStart 12) en de modernere webomgeving (Polaris), waardoor je voor basistaken zoals Excel-exports of marge-boekingen nog steeds de desktop-app moet opstarten [07, 19, +3].

MAANDKOSTEN

Bekijk actuele voorwaarden

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

A

Acumulus

Online boekhoudprogramma voor zzp'ers en starters

Bron: openbare tarieven
Laatst gecontroleerd: 20 juli 2026

Inclusief een mobiele webapp waarmee je onderweg ritten registreert, uren bijhoudt en foto's van bonnetjes uploadt.Gratis unieke e-mailboxen om inkoopfacturen en bonnen direct naar je administratie te sturen.Automatische berekening van de btw-aangifte, ICP en de jaarrekening, die je vervolgens zelf handmatig invult bij de Belastingdienst of via een RGS-brugbestand exporteert naar fiscale software.Automatische bankkoppeling beschikbaar voor €2,95 per maand ex btw per bankrekening.

Waarom aanbevolen: Zeer voordelig vast tarief van €9,95 per maand ex btw (of €113,43 per jaar ex btw bij jaarbetaling) zonder limieten op het aantal boekingen of facturen [01, 04, 05]. Je kunt gratis en onbeperkt extra gebruikers of je boekhouder toegang geven tot je administratie met verschillende rechten [03, 05]. Betrouwbare koppelingen met populaire webshops zoals WooCommerce en Shopify om je verkoopfacturen automatisch te importeren [01, 05].

Minder geschikt als: Snelgroeiende webshops of actieve bedrijven die facturen in bulk willen verzenden of automatische orderreconciliatie nodig hebben [05, 14]. Ondernemers die tijd willen besparen met automatische 'scan & herken' (OCR) voor bonnetjes; je moet de gegevens van je geüploade bonnen namelijk handmatig overtypen [01, 02]. Samenwerkingen met traditionele accountants die eisen dat er met standaard XML-auditbestanden (XAF) of klassiek dubbel boekhouden wordt gewerkt [13, 16].

Belangrijkste beperking: Acumulus wijkt bewust af van klassiek dubbel boekhouden en ondersteunt geen export van standaard XML-auditbestanden (XAF), waardoor je gegevens niet zomaar kunt importeren in andere boekhoudpakketten [08, 13].

MAANDKOSTEN

Bekijk actuele voorwaarden

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

AS

AFAS Software

ERP- en boekhoudsoftware

Bron: openbare tarieven
Laatst gecontroleerd: 20 juli 2026

AFAS Pocket-app voor tweestapsverificatie, urenregistratie en het direct uploaden van bonnen.Automatische aanmaak van een btw-suppletieaangifte zodra correcties boven de drempel van € 1.000,- uitkomen.Gratis Power BI-koppeling en datamodel om zelf diepgaande rapportages te maken, mits je zelf een Microsoft-licentie regelt.

Waarom aanbevolen: Krachtige automatisering voor groeiende bedrijven met directe koppelingen voor de KvK, banken en digitale belastingaangiftes via Digipoort [01, 09]. Compleet pakket voor een vaste prijs van € 59,- p/m (AFAS SB), inclusief 2 gebruikers, 5 administraties en een ingebouwd CRM-systeem [01, 03, 07]. Onbeperkt factureren en inkoopbonnen verwerken zonder extra kosten per transactie dankzij de geïntegreerde scan-en-herkenfunctie [08].

Minder geschikt als: Zzp'ers en kleine eenmanszaken die een simpel en goedkoop boekhoudprogramma zoeken; voor hen is dit pakket vaak te duur en te complex [01, 07, 12]. Ondernemers die direct telefonische hulp verwachten; de support is streng afgeschermd en bellen mag pas na het insturen van een online ticket en het behalen van een verplichte training [09, 10]. Bedrijven die bij een overstap al hun historische boekhoudgegevens willen meenemen, aangezien de import via een auditbestand zich beperkt tot het laatste boekjaar [15].

Belangrijkste beperking: Bij het opzeggen van AFAS SB wordt je administratie volledig verwijderd, tenzij je via een accountant een inkijklicentie van € 2,50 per administratie per maand regelt [04, 11].

MAANDKOSTEN

Bekijk actuele voorwaarden

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Prototype — tarieven en voorwaarden nog niet redactioneel geverifieerd.

Wat kost een boekhoudpakket echt?

Geschatte maandkosten per gebruikssituatie, gebaseerd op de openbare tarieven van elke aanbieder.

Totale kosten = pakketprijs + transactie- of boekingskosten + kosten voor extra gebruikers + eventuele koppelingen.
Kies een scenario:

Dit is een bandbreedte op basis van openbare tarieven (peildatum 20 juli 2026), excl. btw. Werkelijke kosten hangen af van je gebruik.

Vergelijk pakketten

Bekijk de belangrijkste verschillen tussen pakketten naast elkaar.

Pakketten (3/4):
Kenmerk

e-Boekhouden.nl

Online boekhoudpakket

Exact Online

Online boekhoudpakket voor het mkb en accountants

Jortt

Online boekhoudpakket met sterke automatisering

Beste voorStartende ondernemers (tot 15 maanden na KVK-inschrijving) kunnen de software de eerste 15 maanden volledig gratis gebruiken [18].Zeer krachtige en complete ERP- en boekhoudfuncties die geschikt zijn voor complexe bedrijfsprocessen [11, 12].De slimme 'Boekhoudbot' automatiseert tot wel 96% van je banktransacties, waardoor je zelf nauwelijks nog handmatig hoeft te boeken [04, 07, 20].
Geschatte maandkosten
Instappakket
Btw-aangifteDirecte btw- en ICP-aangifte via PKI-certificaten [08].Salarisadministratie optioneel toe te voegen voor €9,50 per loonstrook per actieve medewerker per maand (excl. btw) [07].
BankkoppelingAutomatische bankkoppelingen met ING, Rabobank en bunq zijn gratis; voor andere banken zoals Knab betaal je €0,99 per maand [08, 30].Automatisch afletteren van bankafschriften aan openstaande facturen [01].
KoppelingenAutomatische bankkoppelingen met ING, Rabobank en bunq zijn gratis; voor andere banken zoals Knab betaal je €0,99 per maand [08, 30].
Toegang accountant
Belangrijkste beperkingAls je je abonnement opzegt, wordt je account direct volledig gesloten zonder gratis leesmodus, waardoor je zelf vooraf handmatig al je gegevens en XML-Auditfiles moet exporteren om aan de wettelijke bewaarplicht te voldoen [15, 16, 32].In de pakketten Essentials, Plus en Professional geldt een harde limiet van 10.000 boekingsregels per administratie per maand, waardoor je bij overschrijding verplicht moet upgraden naar het Premium-tarief vanaf €299/maand [01, 03, 09].Bij het opzeggen of downgraden van je abonnement verlies je direct de toegang tot al je opgeslagen documenten en boekingshistorie, waardoor je genoodzaakt bent om zelf tijdig een volledige export te maken of te blijven betalen om aan de fiscale bewaarplicht te voldoen [02, 10, +2].
Laatst gecontroleerd20 juli 202620 juli 202620 juli 2026

Boekhouder.nl kan een vergoeding ontvangen wanneer je via een link een product kiest. Dit heeft geen invloed op onze beoordelingscriteria.

Prototype — tarieven en voorwaarden nog niet redactioneel geverifieerd

Markt & wetgeving: Nieuwe regels voor webshops in 2026

Als e-commerce ondernemer krijg je te maken met steeds strengere regels. Sinds juni 2026 is een duidelijke herroepingsknop op je webshop verplicht [09, 32]. Vergeet je deze knop? Dan wordt de wettelijke bedenktijd van 14 dagen automatisch verlengd naar een heel jaar en 14 dagen [32]. De ACM kan hierbij boetes opleggen tot € 900.000 of een percentage van je jaaromzet [33].

Daarnaast gelden er strikte btw-regels. Verkoop je voor meer dan € 10.000 per jaar aan consumenten in andere EU-landen? Dan moet je de btw van het land van de koper rekenen en dit elk kwartaal aangeven via de One Stop Shop (OSS) [08, 14]. Sinds juli 2026 is ook de douanevrijstelling van € 150 voor import van buiten de EU afgeschaft en vervangen door een vast tarief van € 3 per product [08, 35].

Wat moet je doen? * Zelf regelen: Controleer direct of jouw webshopsoftware een geldige herroepingsknop heeft om boetes te voorkomen [32]. * Software gebruiken: Kies een boekhoudprogramma met een goede OSS-module (zoals Moneybird [01, 02] of Jortt Plus [38]) als je over de grens verkoopt.

Waar moet je op letten bij het kiezen van webshop-boekhoudsoftware?

Niet elk boekhoudprogramma is geschikt voor een webshop. Let vooral op de volgende vier functies:

1. Orderimport en koppelingen Handmatig orders overtypen kost te veel tijd en zorgt voor fouten [01]. Programma's zoals Exact Online [01], Moneybird [01] en e-Boekhouden.nl [01] koppelen direct met Shopify of WooCommerce.

2. PSP-koppeling (afletteren) Klanten betalen via Payment Service Providers (PSP's) zoals Mollie. Je krijgt één verzameluitbetaling, maar in je boekhouding staan honderden losse facturen. Software met een automatische aflettermodule (zoals Exact Online [42] of Jortt [25]) koppelt deze betalingen automatisch. Bij Rompslomp moet je dit bijvoorbeeld handmatig doen [43].

3. Voorraadbeheer Verkoop je fysieke producten? Moneybird [01] en e-Boekhouden.nl [01] hebben geen ingebouwd voorraadbeheer. SnelStart (via inHandel) [01, 03] en Exact Online [01] hebben dit wel.

Wat moet je doen? * Eerst extra controleren: Heb je een fysieke voorraad? Kies dan voor SnelStart [01] of Exact Online [01], of gebruik een extern voorraadsysteem dat koppelt met je boekhouding.

Kosten en verborgen kosten van koppelingen

De basisprijs van boekhoudsoftware lijkt vaak goedkoop, maar voor webshops lopen de kosten snel op door extra koppelingen en datalimieten:

  • Basisprijzen: e-Boekhouden.nl begint bij € 9,95 per maand [01]. Moneybird kost tussen de € 15 en € 42 per maand [01]. SnelStart kost ongeveer € 16 tot € 22 per maand [01, 18]. Exact Online is het duurst met tarieven van € 49 tot € 99 per maand [01].
  • Koppelingen via derden: Soms heb je software van derden nodig (zoals Webwinkelfacturen) om je shop te koppelen. Dit kost je € 80 tot € 180 per jaar extra [24]. Voor een AFAS-koppeling via Conneqt betaal je zelfs vanaf € 277 per maand [36].
  • Transactielimieten: Heb je veel bestellingen? Exact Online rekent € 250 per maand extra voor een 'Volume Pack' met extra boekingsregels en API-calls [20]. SnelStart vraagt een eenmalige certificeringsfee van € 250 exclusief btw voor een eigen API-koppeling [21].

Wat moet je doen? * Zelf regelen: Bereken vooraf je maandelijkse aantal orders. Controleer of de software limieten stelt aan het aantal API-koppelingen of transacties om onverwachte kosten te voorkomen.

Belangrijk bij opzeggen: De 10-jarige bewaarplicht

Voor normale administraties geldt in Nederland een bewaarplicht van 7 jaar [13]. Maar let op: doe je mee aan de EU OSS-regeling voor buitenlandse btw? Dan verplicht de Belastingdienst je om alle transactiegegevens 10 jaar lang te bewaren [13, 29].

Als je stopt met je webshop of overstapt naar andere software, mag je de oude gegevens niet zomaar weggooien. Gelukkig bieden de meeste systemen exportmogelijkheden: * SnelStart: Je kunt je online database gratis kopiëren naar een lokaal SQL-bestand (.mdf) en dit gratis inlezen via SnelStart 12 in een alleen-lezen modus [45]. * Exact Online: Je moet handmatig een XML-auditbestand (XAF) en alle losse PDF-bijlagen exporteren voordat je opzegt, omdat je database daarna wordt verwijderd [46]. * Moneybird: Hiermee kun je een XAF-bestand en een gestructureerd ZIP-bestand met alle inkoop- en verkoopfacturen in PDF- en Excel-formaat downloaden [47].

Wat moet je doen? * Zelf regelen: Zorg dat je bij het opzeggen van je boekhoudpakket direct een volledige export (XAF-bestand en alle originele PDF-facturen) maakt en deze veilig opslaat voor de komende 10 jaar [45, 46, 47].

Veelgemaakte fouten bij het inrichten van je webshop-boekhouding

1
Mollie-uitbetalingen handmatig proberen te koppelen (afletteren)Als je veel bestellingen krijgt, is het handmatig koppelen van verzamelbetalingen van Payment Service Providers (PSP's) zoals Mollie aan losse facturen onbegonnen werk [04]. Sommige programma's zoals Rompslomp vereisen dat je dit handmatig doet [43]. Wat je moet doen: Gebruik software die dit automatisch voor je regelt. Exact Online heeft hiervoor een speciale Mollie-aflettermodule [42] en Jortt biedt dit standaard aan in de ZZP- en MKB-pakketten [25]. Bij e-Boekhouden.nl kan dit ook, maar betaal je een extra vergoeding via een partner [26].
2
De administratie te vroeg weggooien na het opzeggen van je boekhoudsoftwareVoor de normale administratie geldt een bewaarplicht van 7 jaar, maar voor EU OSS-transacties moet je de gegevens wettelijk 10 jaar bewaren [13, 29]. Als je overstapt of stopt en je account simpelweg opzegt, ben je je data kwijt. Wat je moet doen: Regel dit zelf vóór het opzeggen en exporteer je gegevens handmatig. Bij Moneybird doe je dit via een XML Auditfile (XAF) en een ZIP-bestand [47], bij Exact Online via een XAF- of CSV-export [46], en bij SnelStart kun je de database gratis lokaal opslaan en inzien via SnelStart 12 [45].
3
De EU-drempel van €10.000 voor btw negerenZodra je voor meer dan €10.000 per kalenderjaar aan particulieren in andere EU-landen verkoopt, mag je geen Nederlandse btw meer rekenen [08, 14]. Je moet dan de btw van het land van de klant berekenen en dit kwartaalcijfer via de One Stop Shop (OSS) aangeven [08]. Wat je moet doen: Controleer je buitenlandse omzet extra goed. Gebruik software met een sterke OSS-module zoals Moneybird [01, 02] of kies voor het Jortt Plus-abonnement om een OSS-rapportage te krijgen [38]. Bij e-Boekhouden.nl moet je deze buitenlandse btw namelijk handmatig verwerken [04].
4
Geen rekening houden met API-limieten bij snelle groeiAls je webshop snel groeit, sturen je systemen continu data naar je boekhoudprogramma. Veel systemen hebben echter strikte limieten. Moneybird staat bijvoorbeeld maximaal 150 verzoeken per 5 minuten toe [22] en Yuki biedt standaard 1.000 gratis API-aanroepen per dag [23]. Wat je moet doen: Controleer vooraf de limieten van je software. Groei je hard? Schakel dan over naar een pakket dat grote volumes aankan, zoals Exact Online, waar je voor €250 per maand extra Volume Packs kunt kopen voor 25.000 extra boekingsregels [20].
5
Ervan uitgaan dat elk boekhoudprogramma je voorraad bijhoudtVeel ondernemers denken dat voorraadbeheer standaard in elk pakket zit. Dit is niet zo. Populaire programma's zoals Moneybird [01], e-Boekhouden.nl [01] en Jortt [44] hebben geen ingebouwde voorraadfunctie. Wat je moet doen: Heb je een fysieke voorraad die direct moet synchroniseren met je webshop? Gebruik dan software met ingebouwd voorraadbeheer, zoals SnelStart (bijvoorbeeld via SnelStart inHandel) [01, 03] of Exact Online [01]. Anders moet je zelf een externe koppeling regelen.
6
Retouren en terugbetalingen handmatig verwerkenWebshopklanten sturen regelmatig producten terug. Als je boekhoudsoftware retouren niet automatisch verwerkt, ben je uren kwijt aan handmatige creditnota's. Bij e-Boekhouden.nl [01] en Rompslomp [30] moet je retouren handmatig inboeken. Wat je moet doen: Gebruik software die retouren automatisch synchroniseert. Exact Online doet dit bijvoorbeeld automatisch voor Bol.com via de xCore-koppeling [27], Moneybird automatiseert dit via de Shopify-koppeling [40] en Silvasoft ondersteunt dit via een WooCommerce-plugin [39].

Checklist: Boekhoudsoftware kiezen voor jouw webshop

Als webshophouder wil je dat bestellingen, betalingen en retouren automatisch in je boekhouding rollen. Handmatig overtikken kost te veel tijd en vergroot de kans op fouten. Stel jezelf deze 11 praktische vragen om direct te bepalen of je de administratie zelf regelt met de juiste software, of dat je een boekhouder moet inschakelen.

0 van 11 afgevinkt · automatisch lokaal bewaard

Veelgestelde vragen over boekhoudsoftware voor webshops

Hoe zit het met de btw als ik aan klanten in andere EU-landen verkoop?
Verkoop je voor meer dan €10,000 per jaar aan particulieren in andere EU-landen [14]? Dan moet je de btw van het land van de klant rekenen [08]. Je kunt deze buitenlandse btw makkelijk per kwartaal aangeven via de One Stop Shop (OSS) regeling [08]. Let op: voor deze EU-verkopen geldt een bewaarplicht van 10 jaar [13, 29]. Kies voor software met een goede OSS-module, zoals Moneybird [02] of Jortt Plus [38]. Bij e-Boekhouden.nl moet je dit namelijk handmatig invoeren [04].
Hoe bewaar ik mijn administratie als ik stop met mijn webshop of boekhoudprogramma?
Je moet je administratie voor de btw 7 jaar bewaren, en voor EU-OSS-transacties zelfs 10 jaar [13, 29]. Exporteer al je gegevens voordat je je abonnement opzegt [46, 47]. Bij Moneybird doe je dit via een XAF-auditbestand en een ZIP-bestand met al je pdf's [47]. Exact Online biedt ook een XAF-export en CSV-bestanden [46]. SnelStart-gebruikers kunnen de database gratis lokaal opslaan en openen in een gratis read-only versie van SnelStart 12 [45]. Zo voldoe je zonder extra kosten aan de wet.
Kan ik betalingen via Mollie automatisch laten verwerken in mijn boekhouding?
Ja, dat bespaart je veel handmatig werk [01]. Jortt koppelt gratis en leest Mollie-transacties direct in [25]. Exact Online gebruikt een speciale aflettermodule om betalingen automatisch aan open facturen te koppelen [42]. Moneybird koppelt betalingen automatisch via een transactie-id [31]. Bij e-Boekhouden.nl kan dit ook, maar betaal je een extra vergoeding via partner Pspbetalingen.nl [26]. Rompslomp maakt wel facturen aan, maar hier moet je betalingen handmatig koppelen [43].
Hoe koppel ik mijn voorraad aan mijn boekhoudprogramma?
Als je fysieke producten verkoopt, wil je dat je voorraad automatisch bijwerkt [03]. Exact Online [01] en SnelStart (via inHandel) [01, 03] hebben ingebouwde voorraadsystemen. SnelStart Web Compleet Plus kost hiervoor €22/month [01]. Veel goedkopere programma's zoals Moneybird [01], e-Boekhouden.nl [01] en Jortt [44] hebben géén ingebouwde voorraadfunctie. Je moet je voorraad dan in je webshop bijhouden of een extern voorraadprogramma koppelen.
Welke extra of verborgen kosten zijn er bij webshopkoppelingen?
Let goed op de limieten van je software om onverwachte kosten te voorkomen. Exact Online vraagt bijvoorbeeld €250/month extra voor een 'Volume Pack' als je veel API-verkeer hebt [20]. SnelStart vraagt eenmalig €250 ex VAT voor een eigen API-sleutel [21]. Yuki geeft je 1.000 gratis API-oproepen per dag, daarna moet je betalen voor uitbreiding [23]. Gebruik je een tussenpartij zoals Webwinkelfacturen? Die kost tussen de €80 en €180/year, afhankelijk van je aantal transacties [24].
Welke nieuwe regels in 2026 zijn belangrijk voor mijn webshop en administratie?
Sinds juni 2026 moet je webshop een duidelijke herroepingsknop hebben [09, 32]. Heb je die niet? Dan kan de ACM je een boete geven tot €900,000 [33] en krijgt de klant een heel jaar en 14 dagen de tijd om te retourneren [32]. Daarnaast is per 1 juli 2026 de douanevrijstelling voor import onder €150 vervallen; er geldt nu een vast tarief van €3 per productcategorie [35]. Zorg dat je boekhouding hierop is ingericht.
Kan ik als kleine webshop gebruikmaken van btw-vrijstelling in de EU?
Ja, sinds 1 januari 2025 is er de EU-KOR (kleineondernemersregeling) [10, 34]. Als je totale jaaromzet in de hele EU onder de €100,000 blijft, kun je in andere EU-landen btw-vrijstelling aanvragen [10, 34]. Je krijgt dan een speciaal registratienummer met een 'EX-suffix' [34]. Dit scheelt veel administratie. Controleer eerst goed bij de Belastingdienst of je aan alle voorwaarden voldoet voordat je dit toepast.

Zo vergelijken we boekhoudpakketten

We beoordelen elk pakket op vaste criteria met vaste gewichten, waarbij geschiktheid voor het scenario het zwaarst weegt; de ranking staat los van eventuele commerciële relaties.

Geschiktheid voor het scenario
18 pt
Totale geschatte kosten
16 pt
Kernfuncties (facturen, btw, bank)
12 pt
Koppelingen en export
12 pt
Aangiftes (btw/ICP)
10 pt
Gebruiksgemak
8 pt
Schaalbaarheid
8 pt
Support
5 pt
Belangrijkste beperking (aftrek)
3 pt
Onderzocht in deze vergelijking
31 aanbieders onderzocht met openbaar controleerbare tarieven
Tarieven gecontroleerd op peildatum 20 juli 2026, via openbare prijspagina's
Geschatte kosten berekend per scenario: pakketprijs + boekingen + gebruikers
Ranking wordt maandelijks opnieuw berekend na de tariefcontrole
Welke aanbieders zijn onderzocht
Aanbieders die actief in Nederland worden aangeboden aan zzp'ers en kleine bedrijven.
Zowel grote gevestigde pakketten als nieuwere toetreders komen aan bod.
We nemen alleen aanbieders op met openbaar controleerbare tarieven.
Hoe geschatte kosten worden berekend
We gebruiken de laagste, gemiddelde en hoogste pakketten per aanbieder als bandbreedte.
Kosten zijn exclusief btw en gebaseerd op de meest recente openbare prijslijst.
Extra gebruikers, koppelingen en transactiekosten worden waar bekend meegenomen.
Hoe commerciële relaties worden behandeld
Commerciële relaties met aanbieders worden vermeld, maar beïnvloeden de ranking niet.
De volgorde van aanbieders is gebaseerd op de vaste weegcriteria hierboven.
Eventuele vergoedingen wijzigen niets aan de score of tekst per aanbieder.
Fouten melden en correcties
Zie je een fout of verouderd tarief? Meld dit via onze contactpagina.
Onderbouwde correcties verwerken we met bronvermelding.
Aanbieders hebben geen redactioneel veto over de inhoud.

Doorlopend onderzoek

We onderhouden een aantal doorlopende onderzoeksprogramma's om deze pagina actueel te houden.

LOOPT

Kostenindex boekhoudsoftware

Maandelijkse controle van openbare tarieven en pakketwijzigingen per aanbieder.

LOOPT

Koppelingen-monitor (banken & tools)

Doorlopende inventarisatie van bankkoppelingen en integraties per pakket.

IN OPBOUW

Aangifte-doorlooptijden

Onderzoek naar hoe snel en soepel btw-aangiftes via elk pakket verlopen.

IN OPBOUW

Supportkwaliteit per aanbieder

Vergelijkend onderzoek naar responstijd en kwaliteit van klantenservice.

Bronnen

Toon alle bronnen (47)
  1. CL-01Boekhoudsoftware voor Webshops 2026: Top 5 Vergeleken | Bedrijfssoftwaregidsbedrijfssoftwaregids.nl
  2. CL-02Beste Boekhoudsoftware voor een Webshop 2026: BTW-OSS, Voorraad & Shopify | Bedrijfssoftwaregidsbedrijfssoftwaregids.nl
  3. CL-03Optimaliseer je webshop of groothandel | SnelStartwww.snelstart.nl
  4. CL-04Boekhoudprogramma webshop | btw & koppelingen | e-boekhouden.nlwww.e-boekhouden.nl
  5. CL-05Koppel je webshop aan je boekhouding | Informerwww.informer.nl
  6. CL-06Btw buitenland | Rompslomprompslomp.nl
  7. CL-07Webshop zonder Mollie met facturenwww.jortt.nl
  8. CL-08Btw-regels voor e-commerce in de EUwww.kvk.nl
  9. CL-09Online verkopen? Deze 10 basisregels moet je kennenwww.kvk.nl
  10. CL-10Ontdek hoe je de EU-KOR voor je webshop gebruiktwww.kvk.nl
  11. CL-11Belastingtarieven 2026www.kvk.nl
  12. CL-12Uitbreiding OSS, deels al vanaf 1 januari 2027www.sra.nl
  13. CL-13Administratie en boekhouden voor ondernemers & Uw facturen bewarenwww.belastingdienst.nl
  14. CL-14Ik lever goederen van het ene EU-land naar het andere ...www.belastingdienst.nl
  15. CL-15Beste boekhoudsoftware voor ZZP'ers & MKB 2025qonto.com
  16. CL-16Moneybird: Het boekhoudpakket van ruim 400.000 ...www.moneybird.nl
  17. CL-17Exact boekhouden: gids en prijzen | Expert Zoomexpert-zoom.com
  18. CL-18Beste Boekhoudsoftware voor ZZP en MKB vergelijken (2026) | MKB Homepagemkbhomepage.nl
  19. CL-19Eenvoudig online boekhouden & factureren | e-Boekhouden.nlwww.e-boekhouden.nl
  20. CL-20Volume packs | Exactwww.exact.com
  21. CL-21How to Integrate With the SnelStart APIwww.apideck.com
  22. CL-22Moneybird API koppeling | APIkoppelingapikoppeling.nl
  23. CL-23Yuki API link - Yuki Support Nederlandsupport.yuki.nl
  24. CL-24Prijzenwww.webwinkelfacturen.nl
  25. CL-25Boekhoudprogramma Jortt - Koppel Mollie met je boekhoudingwww.jortt.nl
  26. CL-26Koppeling met Molliewww.e-boekhouden.nl
  27. CL-27Bol.com koppeling - Exact Online App Storewww.exact.com
  28. CL-28Amazon koppelen aan SnelStart | SnelStartwww.snelstart.nl
  29. CL-29Hoe lang moet u uw administratie bewaren voor de btw: 7 of 10 jaar? | Belastingdienstwww.belastingdienst.nl
  30. CL-30Retour voorraad inboeken? Houd overzicht in je voorraad met Rompslomp.nl | Rompslomprompslomp.nl
  31. CL-312019-11-19 - Moneybird API Documentationdeveloper.moneybird.com
  32. CL-32ACM roept online retailers op zich voor te bereiden op herroepingsknop - Emercewww.emerce.nl
  33. CL-33Artikel 12m Instellingswet Autoriteit Consument en Markt — Wetten-Overheid.nlwetten-overheid.nl
  34. CL-34Cross-border SME scheme - VAT rules for small enterprises – SME schemesme-vat-rules.ec.europa.eu
  35. CL-35EU Commission Clarifies VAT on €3 Customs Duty for Low-Value Imports – VATupdatewww.vatupdate.com
  36. CL-36AFAS ›› ERP - Webshop koppeling | €277 /mndwww.conneqt.io
  37. CL-37WooCommerce webshop koppelen met Yukiwww.yukisoftware.com
  38. CL-38Het EU-btw éénloketsysteem of One Stop Shop (OSS) regelingwww.jortt.nl
  39. CL-39Silvasoft boekhoudenwordpress.org
  40. CL-40Boekhouding automatiseren met een solide Moneybird koppeling | Shopify App Storeapps.shopify.com
  41. CL-41Mollie koppelen met Moneybird: Zo stel je het in | Combidesk Kennisbankhelp.combidesk.com
  42. CL-42Mollie Aflettermodule - Exact Online App Store | Exactwww.exact.com
  43. CL-43Boekhouding voor jouw webshop | Rompslomprompslomp.nl
  44. CL-44De administratie van je webshopwww.jortt.nl
  45. CL-45Je Snelstart Abonnement opzeggenkennisplein.snelstart.nl
  46. CL-46Je Exact Online-abonnement (gedeeltelijk) opzeggen, een (gedeeltelijke) annulering ongedaan maken, en administraties en gebruikers verwijderensupport.exactonline.com
  47. CL-47Administratie uit ander boekhoudprogramma exporterenbackend.thebookie.nl